Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGRF1Q13972 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRF1Q13972 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms