Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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