Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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HTR4Q13639 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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HTR4Q13639 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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HTR4Q13639 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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