Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAMK2BQ13554 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms