Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPP1R1AQ13522 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms