Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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