Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3B2Q13367 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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