Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCGB2A2Q13296 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms