Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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