Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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SEMA3FQ13275 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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SEMA3FQ13275 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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SEMA3FQ13275 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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SEMA3FQ13275 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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SEMA3FQ13275 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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