Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

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Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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