Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms