Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CTDSPL2Q05D32 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms