Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms