Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms