Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRB3Q04118 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms