Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF85Q03923 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms