Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPCQ03188 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms