Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 TMEM138-202ENST00000381787 1205 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 TYW3-205ENST00000479111 1130 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CACNB1Q02641 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 MFAP3L-202ENST00000393702 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 RPS3AP29-201ENST00000437728 769 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CSTF3-203ENST00000438862 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 ZNF30-AS1-201ENST00000604333 625 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms