Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms