Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2BQ00403 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms