Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms