Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL8P80075 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL8P80075 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms