Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JAG1P78504 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JAG1P78504 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JAG1P78504 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
JAG1P78504 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JAG1P78504 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JAG1P78504 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
JAG1P78504 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
JAG1P78504 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JAG1P78504 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
JAG1P78504 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JAG1P78504 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
JAG1P78504 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JAG1P78504 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JAG1P78504 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JAG1P78504 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
JAG1P78504 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
JAG1P78504 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
JAG1P78504 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JAG1P78504 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
JAG1P78504 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
JAG1P78504 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
JAG1P78504 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
JAG1P78504 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
JAG1P78504 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
JAG1P78504 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
JAG1P78504 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
JAG1P78504 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JAG1P78504 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JAG1P78504 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JAG1P78504 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms