Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms