Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX1P78337 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX1P78337 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX1P78337 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX1P78337 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX1P78337 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX1P78337 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX1P78337 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX1P78337 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX1P78337 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX1P78337 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX1P78337 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX1P78337 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX1P78337 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX1P78337 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX1P78337 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX1P78337 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX1P78337 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX1P78337 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX1P78337 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX1P78337 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX1P78337 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX1P78337 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX1P78337 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX1P78337 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX1P78337 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX1P78337 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX1P78337 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX1P78337 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX1P78337 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX1P78337 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX1P78337 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX1P78337 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX1P78337 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms