Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF3P57682 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF3P57682 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF3P57682 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF3P57682 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF3P57682 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF3P57682 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF3P57682 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF3P57682 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF3P57682 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF3P57682 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF3P57682 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF3P57682 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF3P57682 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF3P57682 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF3P57682 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF3P57682 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms