Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTTPP55157 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTTPP55157 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTTPP55157 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTTPP55157 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTTPP55157 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTTPP55157 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTTPP55157 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTTPP55157 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MTTPP55157 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTTPP55157 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTTPP55157 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTTPP55157 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTTPP55157 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTTPP55157 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTTPP55157 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTTPP55157 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTTPP55157 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTTPP55157 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTTPP55157 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTTPP55157 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTTPP55157 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTTPP55157 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MTTPP55157 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTTPP55157 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTTPP55157 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTTPP55157 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTTPP55157 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MTTPP55157 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTTPP55157 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTTPP55157 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTTPP55157 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTTPP55157 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTTPP55157 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTTPP55157 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTTPP55157 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTTPP55157 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTTPP55157 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTTPP55157 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTTPP55157 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTTPP55157 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTTPP55157 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTTPP55157 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTTPP55157 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTTPP55157 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTTPP55157 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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