Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RORCP51449 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RORCP51449 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RORCP51449 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RORCP51449 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RORCP51449 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RORCP51449 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RORCP51449 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RORCP51449 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RORCP51449 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RORCP51449 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RORCP51449 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RORCP51449 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RORCP51449 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RORCP51449 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RORCP51449 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RORCP51449 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RORCP51449 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RORCP51449 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RORCP51449 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RORCP51449 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RORCP51449 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RORCP51449 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RORCP51449 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RORCP51449 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RORCP51449 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RORCP51449 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RORCP51449 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RORCP51449 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RORCP51449 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RORCP51449 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RORCP51449 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RORCP51449 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RORCP51449 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RORCP51449 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RORCP51449 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RORCP51449 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RORCP51449 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms