Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPIAP49247 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPIAP49247 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPIAP49247 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPIAP49247 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPIAP49247 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPIAP49247 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPIAP49247 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPIAP49247 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPIAP49247 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPIAP49247 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPIAP49247 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms