Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT6CP48668 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms