Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME1P48163 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME1P48163 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME1P48163 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ME1P48163 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ME1P48163 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ME1P48163 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ME1P48163 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ME1P48163 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ME1P48163 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ME1P48163 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ME1P48163 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms