Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGAEP38570 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms