Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACVR1BP36896 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms