Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF4P34130 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF4P34130 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms