Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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CASQ1P31415 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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CASQ1P31415 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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CASQ1P31415 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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CASQ1P31415 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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CASQ1P31415 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASQ1P31415 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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