Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms