Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLD1P28340 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLD1P28340 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLD1P28340 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLD1P28340 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLD1P28340 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms