Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD53P19397 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD53P19397 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD53P19397 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms