Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DSPP15924 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSPP15924 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSPP15924 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DSPP15924 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DSPP15924 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DSPP15924 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DSPP15924 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DSPP15924 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSPP15924 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DSPP15924 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DSPP15924 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSPP15924 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DSPP15924 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DSPP15924 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DSPP15924 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSPP15924 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSPP15924 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSPP15924 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DSPP15924 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DSPP15924 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSPP15924 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSPP15924 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms