Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGAVP06756 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms