Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYBBP04839 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYBBP04839 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYBBP04839 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYBBP04839 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYBBP04839 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYBBP04839 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYBBP04839 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYBBP04839 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYBBP04839 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYBBP04839 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CYBBP04839 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYBBP04839 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYBBP04839 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYBBP04839 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms