Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24BO95487 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms