Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN7O94888 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms