Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCTN3O75935 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCTN3O75935 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms