Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms