Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms