Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN3O15551 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms