Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCAO15360 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCAO15360 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCAO15360 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCAO15360 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCAO15360 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCAO15360 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCAO15360 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCAO15360 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCAO15360 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCAO15360 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCAO15360 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCAO15360 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCAO15360 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCAO15360 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCAO15360 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCAO15360 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCAO15360 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCAO15360 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCAO15360 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCAO15360 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCAO15360 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCAO15360 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCAO15360 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCAO15360 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCAO15360 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCAO15360 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCAO15360 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCAO15360 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCAO15360 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCAO15360 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCAO15360 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCAO15360 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCAO15360 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCAO15360 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCAO15360 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCAO15360 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCAO15360 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCAO15360 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCAO15360 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCAO15360 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCAO15360 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCAO15360 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCAO15360 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCAO15360 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCAO15360 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCAO15360 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCAO15360 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCAO15360 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCAO15360 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCAO15360 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCAO15360 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCAO15360 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCAO15360 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCAO15360 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCAO15360 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCAO15360 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCAO15360 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCAO15360 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCAO15360 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCAO15360 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCAO15360 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCAO15360 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCAO15360 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FANCAO15360 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FANCAO15360 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FANCAO15360 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FANCAO15360 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FANCAO15360 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FANCAO15360 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FANCAO15360 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FANCAO15360 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FANCAO15360 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FANCAO15360 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FANCAO15360 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FANCAO15360 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FANCAO15360 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FANCAO15360 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FANCAO15360 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FANCAO15360 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCAO15360 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCAO15360 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCAO15360 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCAO15360 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCAO15360 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms