Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3EO15041 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms